ARCHS4: Mejorando el análisis de conjuntos de datos de RNA-seq y CHIP-seq.
ARCHS4, desarrollado por maayanlabapps, es una extensión del navegador diseñada para mejorar el análisis de conjuntos de datos de RNA-seq disponibles en el Gene Expression Omnibus (GEO). Esta extensión gratuita agrega contenido valioso a las páginas de inicio de estos conjuntos de datos, proporcionando a los usuarios herramientas y recursos adicionales.
Una de las características clave de ARCHS4 es la capacidad de descargar archivos que contienen las lecturas alineadas mapeadas a genes con recuentos. Esto permite a los investigadores acceder y analizar fácilmente los datos en bruto, lo que permite una exploración e interpretación más profunda de los conjuntos de datos. Además, la extensión ofrece una visualización de mapa de calor resumen de los datos de expresión de las muestras procesadas utilizando Clustergrammer. Esta representación visual proporciona a los usuarios una visión general completa de los patrones de expresión génica dentro del conjunto de datos.
Con ARCHS4, los investigadores pueden acceder y analizar convenientemente conjuntos de datos de RNA-seq, ahorrando tiempo y esfuerzo en su exploración e interpretación de datos. Esta extensión del navegador es una herramienta valiosa para aquellos que trabajan en el campo de la genómica, proporcionando funcionalidad y recursos mejorados para el análisis de conjuntos de datos.
